Mártély couvre un secteur de la plaine d’inondation de la rivière Tisza composé de lacs de bras mort, de prairies humides, de terres arables et de zones boisées et broussailleuses. C’est une aire de reproduction importante pour plusieurs espèces d’oiseaux d’eau protégées au titre de l’annexe 1 de la directive Oiseaux de l’Union européenne, comme le butor étoilé (Botaurus stellaris) ou la spatule blanche (Platalea leucorodia). Le site est aussi une frayère et une zone de croissance importante pour de nombreuses espèces de poissons, à l’image du sterlet (Acipenser nudiventris), une espèce menacée, et il abrite une population conséquente de loutres d’Europe (Lutra lutra). La plaine d’inondation joue un rôle crucial dans la maîtrise des crues, le piégeage des sédiments et la rétention des matières nutritives. Au nombre des activités humaines figurent l’agriculture, la foresterie, la pêche commerciale et les loisirs. On recense parmi les principales menaces qui pèsent sur les caractéristiques écologiques du site la colonisation par des espèces d’arbres envahissantes ; dans la région, la plantation d’espèces de peupliers hybrides artificiels provoque la disparition du peuplier noir (Populus nigra), une espèce indigène. Un projet de restauration des habitats a démarré en 2009 afin de restaurer les prairies humides et d’éliminer les espèces exotiques, et un système national de surveillance de la biodiversité des habitats et des oiseaux a été mis en place.