Le site contient une portion du Rhône à Genève et en aval, s’étendant du lac jusqu’au sud ouest, à la frontière française. Il comprend les berges du lac de Genève et du fleuve dans la ville, les berges du Rhône et les vallées naturelles de l’Allondon et de la Laire, les deux principaux affluents du Rhône dans la région. Le site forme un corridor vert avec une végétation variée et des habitats tels que des roselières, des prairies soumises à une inondation saisonnière, des zones de broussailles et des zones boisées alluviales. Le site comprend certaines des dernières portions relativement non modifiées du Rhône en Suisse et c’est l’un des sites d’hivernage les plus importants pour les oiseaux d’eau du pays. On y trouve 113 espèces protégées au plan européen et plus de 430 espèces figurant sur les listes rouges suisses, notamment le fuligule milouin Aythya ferina menacé au plan mondial et la moule de rivière Unio crassus en danger au plan mondial. Compte tenu de la proximité de la ville, le site a aussi une grande valeur pédagogique et récréative mais subit de nombreuses pressions des activités économiques et récréatives telles que la production hydroélectrique et la présence de deux usines chimiques. Les activités récréatives populaires sont la marche, le cyclisme, le canotage, le rafting et le camping.